Antônio Francisco Pereira de Araújo

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Brasília (1990), graduação em Matemática pela Universidade de Brasília (1992), mestrado em Biologia Molecular pela Universidade de Brasília (1992), doutorado em Graduate Program In Biophysics - Brandeis University (1997) e fez um pós-doutorado na Harvard University (2001/2002) e University of California at San Diego (2009/2009). Atualmente é prof/associado da Universidade de Brasília. Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Enovelamento de Proteínas, atuando principalmente nos seguintes temas: protein folding, lattice model, hydrophobicity, structural segregation e monte carlo simulation, molecular dynamics, protein structure prediction. Trabalha no projeto Enovelamento de Proteínas.

Currículo lattes

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Publicações Selecionadas

 

Sequence-dependent and -independent information in a combined random energy model for protein folding and coding

Antonio F. Pereira de Araujo

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

 

Occurrence and evolutionary conservation analysis of α-helical cationic amphiphilic segments in the human proteome

Igor Costa, Tiago Junot, Fernanda Silva, Wanessa Felix, José L. Cardozo, Antonio F. Pereira de Araujo, Constança Pais, Sónia Gonçalves, Nuno C. Santos, José R. Leite, Carlos Bloch Jr., Guilherme D. Brand

The FEBS Journal

 

Constrained Layer Assignment for the Protein Burial Folding Code Accounting for Chain Connectivity

Marx van der Linden., Diogo Ferreira. and Antonio F. Pereira de Araujo.
The Journal of Physical Chemistry B
 

Information and redundancy in the burial folding code of globular proteins within a wide range of shapes and sizes

Diogo C Ferreira, Marx G van der Linden, Leandro C de Oliveira, José N Onuchic, Antônio FP de Araújo

Proteins

 

Ab initio protein folding simulations using atomic burials as informational intermediates between sequence and structure

Marx G van der Linden, Diogo C Ferreira, Leandro C de Oliveira, José N Onuchic, Antônio FP de Araújo

Proteins

 

Information-theoretic analysis and prediction of protein atomic burials: On the search for an informational intermediate between sequence and structure

Juliana R Rocha, Marx G van der Linden, Diogo C Ferreira, Paulo H Azevêdo, Antônio FP de Araújo

Bioinformatics

 

A sequence-compatible amount of native burial information is sufficient for determining the structure of small globular proteins

Antônio FP de Araújo, José N Onuchic

Proceedings of the National Academy of Sciences

 

Native atomic burials, supplemented by physically motivated hydrogen bond constraints, contain sufficient information to determine the tertiary structure of small globular proteins

Antônio FP de Araújo, Antonio LC Gomes, Alexandre A Bursztyn,  Eugene I Shakhnovich

Proteins